Bãi bỏ hoàn thuế GTGT 2026: 18 thủ tục doanh nghiệp cần biết ngay

Quyết định 1934/QĐ-BTC 2026: Bãi bỏ thủ tục hoàn thuế GTGT cho doanh nghiệp, tổ chức

Bạn có biết rằng từ 20/07/2026, 18 thủ tục hành chính liên quan đến hoàn thuế giá trị gia tăng (GTGT) và một số loại thuế khác sẽ chính thức bị bãi bỏ tại Việt Nam? Bộ Tài chính đã ban hành Quyết định 1934/QĐ-BTC năm 2026, đánh dấu một thay đổi quan trọng trong lĩnh vực quản lý thuế. Điều quan trọng cần nhấn mạnh là Quyết định này chỉ bãi bỏ các thủ tục hành chính, không thay đổi chính sách thuế hay nghĩa vụ thuế của người nộp thuế. Các doanh nghiệp tại Long Biên, Hà Nội và trên cả nước cần đặc biệt lưu ý những thay đổi này để đảm bảo tuân thủ và quản lý dòng tiền hiệu quả.

Chi tiết 18 thủ tục bị bãi bỏ và căn cứ pháp lý

Theo Quyết định 1934/QĐ-BTC, các thủ tục sau sẽ không còn tồn tại từ ngày 20/07/2026. Việc bãi bỏ này nhằm mục đích đơn giản hóa quy trình hành chính, nhưng doanh nghiệp vẫn cần hiểu rõ để tránh nhầm lẫn.

• 1. Đăng ký sử dụng dịch vụ TVAN và các thay đổi, bổ sung thông tin, ngừng sử dụng dịch vụ TVAN.
• 2. Khai miễn thuế TNCN đối với cá nhân là người Việt Nam làm việc tại cơ quan đại diện của tổ chức quốc tế thuộc hệ thống Liên hợp quốc tại Việt Nam.
• 3. Khai miễn thuế TNCN đối với Chuyên gia nước ngoài thực hiện chương trình, dự án viện trợ phi Chính phủ nước ngoài tại Việt Nam.
• 4. Khai quyết toán phí bảo vệ môi trường đối với khai thác khoáng sản.
• 5. Khai quyết toán thuế tài nguyên đối với cơ sở khai thác tài nguyên.
• 6. Khai thuế TNDN tạm tính đối với thu nhập từ tiền kết dư của phần dầu để lại; Khai phụ thu tạm tính đối với dầu lãi từ tiền kết dư của phần dầu để lại áp dụng cho Liên doanh Vietsovpetro tại Lô 09.1.
• 7. Khai quyết toán thuế tài nguyên đối với hoạt động khai thác, xuất bán dầu thô, khí thiên nhiên (trừ Lô 09.1).
• 8. Khai các khoản thu về hoa hồng dầu, khí, tiền thu về đọc và sử dụng tài liệu dầu, khí.
• 9. Khai thuế tạm tính và quyết toán TNDN đối với hoạt động khai thác, xuất bán dầu thô, khí thiên nhiên (trừ Lô 09.1).
• 10. Khai tạm tính tiền lãi dầu, khí nước chủ nhà đối với hoạt động dầu khí.
• 11. Khai quyết toán tiền lãi dầu, khí nước chủ nhà đối với hoạt động dầu khí.
• 12. Khai phụ thu tạm tính đối với phần dầu lãi được chia của nhà thầu dầu khí khi giá dầu thô biến động tăng (trừ Lô 09.1).
• 13. Xóa nợ tiền thuế, tiền phạt phát sinh trước ngày 01/07/2007 đối với doanh nghiệp nhà nước hoàn thành cổ phần hóa hoặc doanh nghiệp nhà nước thực hiện chuyển đổi sở hữu theo hình thức giao, bán.
• 14. Giảm thuế tiêu thụ đặc biệt đối với người nộp thuế sản xuất hàng hóa thuộc diện chịu thuế tiêu thụ đặc biệt gặp khó khăn do thiên tai, tai nạn bất ngờ theo pháp luật về thuế tiêu thụ đặc biệt.
• 15. Hoàn thuế giá trị gia tăng của doanh nghiệp, tổ chức.
• 16. Hoàn thuế tiêu thụ đặc biệt đối với xăng sinh học.
• 17. Hoàn thuế GTGT đầu vào chưa được khấu trừ hết khi doanh nghiệp, tổ chức giải thể, phá sản (mã 1.008564).
• 18. Hoàn thuế TNCN đối với tổ chức, cá nhân trả thu nhập từ tiền lương, tiền công thực hiện quyết toán cho các cá nhân có ủy quyền quyết toán thuế.

Việc bãi bỏ các thủ tục này dựa trên Luật số 108/2025/QH15 về quản lý thuế và Thông tư 94/2026/TT-BTC quy định về quản lý tuân thủ, quản lý rủi ro trong quản lý thuế.

Hiểu rõ bản chất: Bãi bỏ thủ tục, không bãi bỏ chính sách thuế GTGT

Một trong những điểm gây hiểu lầm lớn nhất từ Quyết định 1934/QĐ-BTC là việc bãi bỏ thủ tục hoàn thuế GTGT. Nhiều doanh nghiệp có thể lo ngại rằng họ sẽ mất quyền được hoàn thuế. Tuy nhiên, cần khẳng định rõ ràng rằng quy định này chỉ loại bỏ các thủ tục hành chính cụ thể để yêu cầu hoàn thuế, chứ không hề bãi bỏ chính sách thuế về hoàn thuế GTGT hay nghĩa vụ thuế của người nộp thuế.

Điều này có nghĩa là, nếu doanh nghiệp có số thuế GTGT đầu vào chưa được khấu trừ hết và đủ điều kiện hoàn thuế theo Luật Thuế GTGT hiện hành, quyền lợi đó vẫn được bảo toàn. Vấn đề là cơ chế để thực hiện quyền lợi này sẽ không còn thông qua các thủ tục đã bị bãi bỏ. Doanh nghiệp cần theo dõi các hướng dẫn mới từ Bộ Tài chính hoặc Cục Thuế Hà Nội để biết cách thức xử lý các khoản thuế này, có thể là thông qua khấu trừ vào kỳ tiếp theo, hoặc các quy trình mới sẽ được ban hành.

Ví dụ thực tế: Công ty A có doanh thu 5 tỷ đồng/năm, đã nộp 1 tỷ đồng thuế GTGT và dự kiến được hoàn 200 triệu đồng. Sau khi Quyết định 1934 có hiệu lực, công ty sẽ không thể yêu cầu hoàn 200 triệu đồng thông qua các thủ tục đã bãi bỏ này. Thay vào đó, khoản thuế này có thể được khấu trừ vào kỳ tiếp theo, hoặc công ty cần chờ hướng dẫn mới về cơ chế xử lý các khoản hoàn thuế GTGT chưa được khấu trừ hết.

Các bước doanh nghiệp cần thực hiện để thích nghi với quy định mới

Để tránh gián đoạn hoạt động và đảm bảo tuân thủ, doanh nghiệp cần chủ động thực hiện các bước sau:

1. Kiểm tra danh sách thủ tục hiện tại: Rà soát các quy trình nội bộ để xác định xem doanh nghiệp có đang sử dụng bất kỳ trong 18 thủ tục đã bị bãi bỏ hay không.
2. Rà soát hợp đồng và chứng từ: Điều chỉnh hoặc loại bỏ các điều khoản trong hợp đồng, chứng từ kế toán có liên quan trực tiếp đến các thủ tục đã bị bãi bỏ để phù hợp với quy định mới.
3. Cập nhật phần mềm kế toán: Yêu cầu nhà cung cấp phần mềm kế toán cập nhật phiên bản mới, đảm bảo không còn hiển thị các mẫu hồ sơ hoặc quy trình liên quan đến các thủ tục đã bị xóa.
4. Đào tạo nhân viên: Tổ chức các buổi đào tạo ngắn hạn cho đội ngũ kế toán, tài chính về những thay đổi này, đặc biệt là về cách thức xử lý các khoản thuế GTGT đầu vào chưa được khấu trừ hết.
5. Liên hệ cơ quan thuế địa phương: Chủ động liên hệ Chi cục Thuế Long Biên hoặc Cục Thuế Hà Nội để được hướng dẫn chi tiết về cách thức xử lý các hồ sơ còn tồn đọng hoặc các khoản thuế GTGT chưa được hoàn theo quy định mới.
6. Thực hiện kiểm tra nội bộ: Đánh giá lại hệ thống quản lý tuân thủ thuế của doanh nghiệp dựa trên các tiêu chí rủi ro được quy định trong Thông tư 94/2026/TT-BTC để chuẩn bị cho các quy trình kiểm tra mới.

Quản lý rủi ro trong hoàn thuế GTGT theo Thông tư 94/2026/TT-BTC

Sau khi các thủ tục hoàn thuế GTGT bị bãi bỏ, việc quản lý rủi ro trong hoàn thuế trở nên càng quan trọng. Thông tư 94/2026/TT-BTC của Bộ Tài chính, có hiệu lực từ ngày 01/07/2026, quy định chi tiết về việc áp dụng quản lý tuân thủ và quản lý rủi ro trong quản lý thuế, bao gồm cả hoạt động hoàn thuế.

Theo Điều 16 của Thông tư 94/2026/TT-BTC, cơ quan thuế sẽ phân loại người nộp thuế có hồ sơ hoàn thuế dựa trên Luật Quản lý thuế số 108/2025/QH15 và các văn bản hướng dẫn. Việc phân loại rủi ro (cao, trung bình, thấp) sẽ căn cứ vào kết quả phân loại tại Điều 13 của Thông tư này và các thông tin nghiệp vụ tại thời điểm ban hành Quyết định hoàn thuế. Dựa trên mức độ rủi ro, cơ quan thuế sẽ áp dụng các biện pháp phù hợp trong giải quyết, xử lý hồ sơ hoàn thuế.

Ví dụ, đối với người nộp thuế có hồ sơ hoàn thuế GTGT được xếp vào nhóm rủi ro cao, cơ quan thuế có thể thực hiện kiểm tra trước, hoàn thuế sau. Điều này nhấn mạnh tầm quan trọng của việc doanh nghiệp phải duy trì hồ sơ kế toán minh bạch, tuân thủ chặt chẽ các quy định thuế để giảm thiểu rủi ro và đảm bảo quá trình xử lý thuế diễn ra thuận lợi.

Câu hỏi thường gặp về những thay đổi trong hoàn thuế GTGT

Doanh nghiệp có phải trả lại số tiền đã được hoàn thuế GTGT trước ngày 20/07/2026 không?

Không. Theo Quyết định 1934/QĐ-BTC, các khoản hoàn thuế đã được chi trả trước ngày 20/07/2026 không bị thu hồi. Tuy nhiên, sau ngày này, doanh nghiệp sẽ không thể sử dụng các thủ tục đã bãi bỏ để yêu cầu hoàn thuế. Các khoản thuế GTGT đầu vào chưa được khấu trừ hết sẽ được xử lý theo các quy định hiện hành về khấu trừ hoặc các hướng dẫn mới (nếu có) từ cơ quan thuế.

Làm sao để phân loại rủi ro hồ sơ thuế sau khi thủ tục hoàn thuế GTGT bị bãi bỏ?

Phân loại rủi ro dựa trên Thông tư 94/2026/TT-BTC – Điều 13 và Điều 16. Doanh nghiệp cần xác định mức độ rủi ro (cao, trung bình, thấp) dựa trên tiêu chí như lịch sử kiểm tra, số tiền đề nghị hoàn, và dấu hiệu bất thường. Hệ thống quản lý tuân thủ của cơ quan thuế sẽ tự động gán mức rủi ro và đề xuất biện pháp kiểm tra phù hợp, ví dụ như kiểm tra trước hoàn thuế sau đối với hồ sơ rủi ro cao.

Trong trường hợp doanh nghiệp vẫn muốn khấu trừ thuế GTGT, có cần thực hiện thủ tục gì mới không?

Việc khấu trừ thuế GTGT là một chính sách thuế cơ bản và không bị ảnh hưởng bởi Quyết định 1934/QĐ-BTC. Doanh nghiệp vẫn tiếp tục thực hiện khấu trừ thuế GTGT đầu vào theo quy định hiện hành của Luật Thuế GTGT và các văn bản hướng dẫn. Quyết định này chỉ bãi bỏ các thủ tục hành chính liên quan đến việc hoàn thuế, không phải việc khấu trừ thuế. Do đó, không có thủ tục mới nào cần thực hiện cho việc khấu trừ thuế GTGT.

Tóm lại, Quyết định 1934/QĐ-BTC năm 2026 mang đến những thay đổi đáng kể trong quy trình hành chính thuế, đặc biệt là việc bãi bỏ 18 thủ tục, trong đó có thủ tục hoàn thuế GTGT cho doanh nghiệp, tổ chức. Các doanh nghiệp cần nắm vững tinh thần của Quyết định là bãi bỏ thủ tục chứ không phải chính sách, đồng thời chủ động cập nhật thông tin và điều chỉnh quy trình nội bộ để đảm bảo tuân thủ. Việc hiểu rõ Thông tư 94/2026/TT-BTC về quản lý rủi ro cũng sẽ giúp doanh nghiệp chuẩn bị tốt hơn cho các hoạt động kiểm tra thuế trong tương lai.