Khai Bổ Sung Hồ Sơ Khai Thuế 2026: Hướng Dẫn Chi Tiết Từ 01/07/2026 Theo Thông Tư 89/2026/TT-BTC
Từ 01/07/2026, quy trình khai bổ sung hồ sơ khai thuế chính thức thay đổi – Hàng triệu doanh nghiệp cần chuẩn bị
Từ ngày 01 tháng 7 năm 2026, một cột mốc quan trọng trong công tác quản lý thuế tại Việt Nam sẽ chính thức có hiệu lực, mang đến những thay đổi đáng kể trong quy trình khai bổ sung hồ sơ khai thuế. Theo đó, Bộ Tài chính đã ban hành Thông tư 89/2026/TT-BTC, hướng dẫn thi hành Nghị định 252/2026/NĐ-CP và Luật Quản lý thuế, tác động trực tiếp đến hàng triệu doanh nghiệp, hộ kinh doanh và cá nhân kinh doanh trên cả nước. Đặc biệt, các doanh nghiệp tại Long Biên, Hà Nội cần lưu ý các hướng dẫn của Chi cục Thuế Long Biên và Cục Thuế Hà Nội để thực hiện đúng quy định.
Quy định mới này được thiết kế nhằm tăng cường tính minh bạch, hiệu quả trong quản lý thuế, đồng thời tạo điều kiện thuận lợi hơn cho người nộp thuế trong việc tự giác điều chỉnh các sai sót. Tuy nhiên, việc không nắm rõ hoặc áp dụng sai các quy định mới có thể dẫn đến những rủi ro pháp lý và các khoản phạt không đáng có. Do đó, việc cập nhật kiến thức và chuẩn bị kỹ lưỡng là vô cùng cần thiết cho mọi tổ chức, cá nhân có nghĩa vụ thuế tại Việt Nam.
Chi tiết quy định về hồ sơ và cách thức khai bổ sung theo Thông tư 89/2026/TT-BTC
Thông tư 89/2026/TT-BTC, ban hành ngày 30/6/2026, đã cụ thể hóa các yêu cầu về hồ sơ và cách thức khai bổ sung hồ sơ khai thuế, thay thế các quy định trước đây. Đây là căn cứ pháp lý quan trọng mà mọi người nộp thuế cần nắm vững.
1. Hồ sơ khai bổ sung hồ sơ khai thuế
Theo khoản 3 Điều 17 Thông tư 89/2026/TT-BTC, hồ sơ khai bổ sung sẽ bao gồm các mẫu biểu và tài liệu sau (theo Phụ lục I):
| Mẫu tờ khai | Tên hồ sơ | Tải về | Mô tả |
|---|---|---|---|
| 01/KHBS | Tờ khai bổ sung | Tải về | Tờ khai tổng hợp các thông tin điều chỉnh, bổ sung cho kỳ tính thuế có sai sót. |
| 01-1/KHBS | Bản giải trình khai bổ sung | Tải về | Bản giải trình chi tiết về nội dung sai sót, lý do sai sót và cách thức điều chỉnh. |
| Kèm theo: |
| ||
Lưu ý đặc biệt đối với hộ kinh doanh, cá nhân kinh doanh: Đối với các đối tượng này đã khai thuế theo Thông tư 18/2026/TT-BTC (được sửa đổi, bổ sung bởi Thông tư 50/2026/TT-BTC), hồ sơ khai bổ sung sẽ đơn giản hơn, chỉ là hồ sơ khai thuế của kỳ tính thuế có sai, sót đã được bổ sung. Điều này nhằm giảm bớt gánh nặng hành chính cho các đối tượng này.
2. Cách thức khai bổ sung hồ sơ khai thuế từ 01/07/2026
Phụ lục 2 ban hành kèm theo Thông tư 89/2026/TT-BTC quy định chi tiết cách thức khai bổ sung, dựa trên Điều 12 Nghị định 252/2026/NĐ-CP. Các quy định này phân loại rõ ràng theo từng trường hợp và loại thuế:
a. Quy định chung về khai bổ sung
- Trường hợp chưa nộp hồ sơ khai quyết toán thuế: Người nộp thuế (NNT) phải khai bổ sung hồ sơ khai thuế của tháng, quý có sai sót. Đồng thời, NNT cần tổng hợp số liệu đã khai bổ sung vào hồ sơ khai quyết toán thuế.
- Trường hợp đã nộp hồ sơ khai quyết toán thuế: NNT chỉ cần khai bổ sung hồ sơ khai quyết toán thuế, trừ trường hợp đặc biệt đối với thuế TNCN (sẽ được đề cập dưới đây).
b. Khai bổ sung hồ sơ quyết toán thuế TNCN đối với tổ chức, cá nhân trả thu nhập
Đây là một điểm quan trọng cần lưu ý: Khi khai bổ sung hồ sơ quyết toán thuế TNCN đối với tổ chức, cá nhân trả thu nhập từ tiền lương, tiền công, NNT đồng thời phải khai bổ sung hồ sơ khai thuế của quý có sai sót tương ứng. Quy định này áp dụng không phân biệt đã nộp hay chưa nộp hồ sơ khai quyết toán thuế. Điều này đảm bảo sự đồng bộ giữa dữ liệu khai theo quý và dữ liệu quyết toán năm.
c. Khai bổ sung hồ sơ khai thuế GTGT – Các tình huống phức tạp
Thuế GTGT thường có nhiều tình huống phức tạp khi khai bổ sung do liên quan đến khấu trừ, hoàn thuế và các kỳ tính thuế khác nhau. Thông tư 89/2026/TT-BTC đã đưa ra hướng dẫn chi tiết cho từng trường hợp:
- Trường hợp chỉ làm tăng số thuế GTGT chưa khấu trừ hết chuyển kỳ sau:
- NNT lập hồ sơ khai bổ sung của kỳ tính thuế có sai sót.
- Số tiền thuế GTGT được khấu trừ điều chỉnh tăng của kỳ tính thuế có sai sót sẽ được khai vào chỉ tiêu “Điều chỉnh tăng số thuế GTGT còn được khấu trừ của các kỳ trước” trên tờ khai thuế GTGT của kỳ tính thuế phát hiện sai sót.
- Lưu ý: Trường hợp này không áp dụng nếu NNT phát hiện sai sót ở số thuế GTGT đầu vào khi kê khai, khấu trừ.
- Trường hợp làm giảm số thuế GTGT chưa khấu trừ hết chuyển kỳ sau:
- Nếu chưa đề nghị hoàn thuế: Lập hồ sơ khai bổ sung của kỳ tính thuế có sai sót. Số tiền thuế GTGT được khấu trừ điều chỉnh giảm sẽ khai vào chỉ tiêu “Điều chỉnh giảm số thuế GTGT còn được khấu trừ của các kỳ trước” trên tờ khai thuế GTGT của kỳ tính thuế phát hiện sai sót.
- Nếu đã đề nghị hoàn thuế nhưng chưa được hoàn và thuộc trường hợp hủy hồ sơ hoàn thuế (theo khoản 2 Điều 47 Thông tư 89/2026/TT-BTC): NNT gửi văn bản đề nghị hủy hồ sơ hoàn thuế đến cơ quan thuế, sau đó khai giảm chỉ tiêu “đề nghị hoàn” trên hồ sơ khai bổ sung. Nếu số tiền đáp ứng điều kiện khấu trừ, phần giảm sẽ được khai vào chỉ tiêu “Điều chỉnh tăng số thuế GTGT còn được khấu trừ của các kỳ trước”.
Kết luận
Áp dụng Thông tư 89/2026/TT-BTC từ ngày 01/07/2026, doanh nghiệp và hộ kinh doanh tại Hà Nội, đặc biệt là khu vực Long Biên, cần rà soát lại quy trình khai bổ sung hồ sơ khai thuế để tránh sai sót và giảm thiểu rủi ro phạt. Việc nắm rõ các mẫu biểu, tài liệu kèm theo và cách thức khai bổ sung theo từng loại thuế sẽ giúp doanh nghiệp thực hiện đúng quy định, đồng thời tối ưu hoá quy trình thuế nội bộ.