Thông tư 90/2026/TT-BTC mở rộng trường hợp khôi phục mã số thuế – Doanh nghiệp cần biết gì ngay?
Bạn có biết rằng từ 01/07/2026, Bộ Tài chính sẽ cho phép khôi phục mã số thuế trong nhiều trường hợp mới, ảnh hưởng tới hàng ngàn doanh nghiệp, hợp tác xã và đơn vị phụ thuộc tại Việt Nam? Quy định mới được đưa ra trong Thông tư 90/2026/TT-BTC và dựa trên Luật Quản lý thuế 2019. Ngay sau đây, chúng tôi sẽ giải thích chi tiết quy định, các bước thực hiện, hạn nộp và mức phạt nếu vi phạm.

Chi tiết quy định khôi phục mã số thuế và căn cứ pháp lý
Theo Điều 17 của Thông tư 90/2026/TT-BTC, các trường hợp khôi phục mã số thuế được bổ sung như sau:
| Nhóm đăng ký | Trường hợp khôi phục | Nội dung chi tiết | Căn cứ pháp lý |
|---|---|---|---|
| Đăng ký qua một cửa (doanh nghiệp, hợp tác xã, đăng ký kinh doanh) | Khôi phục tình trạng pháp lý | Doanh nghiệp được khôi phục tình trạng pháp lý theo luật doanh nghiệp, hợp tác xã hoặc đăng ký kinh doanh thì đồng thời được khôi phục mã số thuế. | Luật Quản lý thuế 2019, khoản 1, Điều 17; Thông tư 90/2026/TT-BTC, khoản 1. |
| Thông báo không hoạt động nhưng chưa thu hồi giấy phép | Cơ quan thuế thông báo người nộp thuế không hoạt động tại địa chỉ đã đăng ký, nhưng chưa thu hồi giấy phép và chưa chấm dứt mã số. | Luật Quản lý thuế 2019, khoản 2, Điều 17; Thông tư 90/2026/TT-BTC, khoản 1. | |
| Đơn vị phụ thuộc muốn tiếp tục hoạt động | Đơn vị phụ thuộc đã nộp hồ sơ chấm dứt hiệu lực mã số thuế nhưng chưa nộp hồ sơ chấm dứt hoạt động đến cơ quan đăng ký kinh doanh. | Thông tư 90/2026/TT-BTC, khoản 5, Điều 13. | |
| Đăng ký trực tiếp với cơ quan thuế | Hủy bỏ thu hồi giấy phép thành lập | Doanh nghiệp có văn bản hủy bỏ thu hồi giấy phép thành lập, hoạt động hoặc giấy phép tương đương. | Luật Quản lý thuế 2019, khoản 1, Điều 17; Thông tư 90/2026/TT-BTC, khoản 2. |
| Thông báo không hoạt động nhưng chưa thu hồi giấy phép | Cơ quan thuế thông báo người nộp thuế không hoạt động tại địa chỉ đã đăng ký, nhưng chưa thu hồi giấy phép và chưa chấm dứt mã số. | Luật Quản lý thuế 2019, khoản 2, Điều 17; Thông tư 90/2026/TT-BTC, khoản 2. | |
| Tiếp tục kinh doanh sau khi đã có hồ sơ chấm dứt | Doanh nghiệp đã gửi hồ sơ chấm dứt hiệu lực mã số thuế nhưng cơ quan thuế chưa ban hành thông báo chấm dứt. | Thông tư 90/2026/TT-BTC, khoản 2, Điều 13. |
Những quy định trên được xây dựng dựa trên Luật Quản lý thuế 2019, đảm bảo tính pháp lý và minh bạch cho người nộp thuế. Tại Chi cục Thuế Long Biên, Hà Nội, doanh nghiệp có thể nhận được hỗ trợ chi tiết về quy trình khôi phục.
Các bước thực hiện khôi phục mã số thuế từ 01/07/2026
Để khôi phục mã số thuế, doanh nghiệp cần thực hiện các bước sau đây một cách tuần tự:
- Bước 1: Xác định trường hợp áp dụng – Kiểm tra xem doanh nghiệp thuộc một trong các trường hợp nêu trên.
- Bước 2: Chuẩn bị hồ sơ – Bao gồm mẫu văn bản đề nghị khôi phục mã số thuế (theo mẫu quy định của cơ quan thuế) và các tài liệu kèm theo (bản sao văn bản hủy bỏ thu hồi giấy phép, thông báo không hoạt động, hoặc quyết định hủy quyết định chấm dứt).
- Bước 3: Nộp hồ sơ tới cơ quan thuế quản lý trực tiếp – Đối với doanh nghiệp đăng ký qua một cửa, nộp tại cơ quan đăng ký kinh doanh; đối với đăng ký trực tiếp, nộp tại cơ quan thuế địa phương (ví dụ: Chi cục Thuế Long Biên).
- Bước 4: Hoàn thành nghĩa vụ thuế – Trước khi mã số được khôi phục, doanh nghiệp phải thanh toán đầy đủ các khoản thuế còn nợ.
- Bước 5: Nhận kết quả – Cơ quan thuế sẽ xem xét và trả kết quả trong vòng 10 ngày làm việc kể từ ngày nhận hồ sơ.
Ví dụ thực tế: Công ty A có mã số thuế 123456789, bị thu hồi giấy phép thành lập vào tháng 3/2026. Vào tháng 5/2026, cơ quan có thẩm quyền ban hành quyết định hủy bỏ thu hồi. Công ty A cần nộp mẫu đề nghị và bản sao quyết định hủy bỏ trong vòng 10 ngày làm việc để khôi phục mã số.
Mức phạt và những điểm dễ sai khi khôi phục mã số thuế
Việc không tuân thủ đúng quy trình có thể dẫn đến các hình phạt sau:
- Không nộp đầy đủ hồ sơ trong thời hạn quy định – phạt tiền từ 5.000.000 đến 20.000.000 đồng theo quy định hiện hành.
- Không hoàn thành nghĩa vụ thuế trước khi khôi phục – phạt truy thu thuế và tiền lãi theo quy định hiện hành.
- Gửi hồ sơ sai địa chỉ hoặc thiếu thông tin – cơ quan thuế có thể từ chối xử lý và yêu cầu nộp lại, gây trì hoãn.
Những lỗi thường gặp:
- Không đính kèm bản sao quyết định hủy bỏ thu hồi giấy phép.
- Quên cập nhật địa chỉ trụ sở mới khi nộp hồ sơ.
- Không thanh toán đầy đủ các khoản thuế còn nợ trước khi yêu cầu khôi phục.
Câu hỏi thường gặp (FAQ)
Doanh nghiệp có thể khôi phục mã số thuế nếu đã nộp hồ sơ chấm dứt nhưng chưa nhận thông báo chấm dứt?
Đúng. Theo khoản 2, Điều 13 Thông tư 90/2026/TT-BTC, nếu cơ quan thuế chưa ban hành thông báo chấm dứt hiệu lực mã số thuế, doanh nghiệp vẫn có thể nộp đề nghị khôi phục, miễn là hồ sơ đầy đủ và các nghĩa vụ thuế đã được thanh toán.
Trong trường hợp giấy phép thành lập bị thu hồi, doanh nghiệp cần bao lâu để khôi phục mã số thuế?
Doanh nghiệp phải nộp hồ sơ khôi phục trong vòng 10 ngày làm việc kể từ ngày cơ quan có thẩm quyền ban hành văn bản hủy bỏ thu hồi. Nếu đáp ứng đúng thời hạn, cơ quan thuế sẽ xem xét và trả kết quả trong 10 ngày làm việc tiếp theo.
Đơn vị phụ thuộc đã nộp hồ sơ chấm dứt mã số thuế, nhưng sau đó có quyết định hủy
Trong trường hợp này, đơn vị phụ thuộc có thể nộp đề nghị khôi phục mã số thuế dựa trên quyết định hủy quyết định chấm dứt, theo khoản 5, Điều 13 của Thông tư 90/2026/TT-BTC.