Hướng dẫn kê khai và nộp thuế khi tài sản cố định nhập khẩu thay đổi mục đích sử dụng tại Việt Nam
Trong bối cảnh hội nhập kinh tế sâu rộng, việc nhập khẩu tài sản cố định (TSCĐ) để phục vụ sản xuất, kinh doanh là hoạt động thường xuyên của các doanh nghiệp tại Việt Nam. Tuy nhiên, nhiều doanh nghiệp có thể đang bỏ qua hoặc chưa nắm rõ các quy định về nghĩa vụ thuế khi những tài sản này thay đổi mục đích sử dụng ban đầu. Điều này tiềm ẩn rủi ro rất lớn về phạt hành chính, truy thu thuế và ảnh hưởng nghiêm trọng đến tình hình tài chính, uy tín của doanh nghiệp, đặc biệt là các đơn vị hoạt động tại khu vực Long Biên, Hà Nội, nơi có nhiều hoạt động xuất nhập khẩu sôi động.

Việc thay đổi mục đích sử dụng đối với hàng hóa nhập khẩu, đặc biệt là tài sản cố định đã được hưởng ưu đãi thuế (miễn thuế, giảm thuế) khi nhập khẩu, không chỉ đơn thuần là một quyết định kinh doanh nội bộ. Theo quy định pháp luật Việt Nam, đây là một sự kiện pháp lý quan trọng làm phát sinh nghĩa vụ kê khai và nộp thuế mới. Các doanh nghiệp nhập khẩu máy móc, thiết bị, dây chuyền sản xuất được miễn thuế nhập khẩu hoặc thuế giá trị gia tăng (GTGT) theo các chương trình ưu đãi đầu tư, sau đó lại quyết định bán thanh lý, chuyển nhượng, hoặc sử dụng vào mục đích không còn được ưu đãi, đều phải thực hiện lại thủ tục hải quan và kê khai, nộp thuế theo chính sách hiện hành.
Hậu quả của việc không tuân thủ có thể rất nặng nề, bao gồm việc bị truy thu toàn bộ số thuế đã được miễn hoặc giảm, cộng thêm tiền chậm nộp và các khoản phạt hành chính theo quy định của Luật Quản lý thuế. Điều này không chỉ gây thiệt hại về tài chính mà còn làm mất thời gian, công sức của doanh nghiệp trong việc giải trình với cơ quan thuế và hải quan. Bài viết này của ANC Việt Nam sẽ cung cấp một hướng dẫn chi tiết về quy trình kê khai và nộp thuế đối với hàng hóa nhập khẩu là tài sản cố định thay đổi mục đích sử dụng. Lưu ý quan trọng: Các quy định pháp luật được đề cập trong bài viết này, đặc biệt là Nghị định 167/2025/NĐ-CP, Nghị định 181/2025/NĐ-CP và Thông tư 86/2026/TT-BTC, là các văn bản dự kiến có hiệu lực trong tương lai (năm 2025, 2026). Doanh nghiệp cần tham khảo các quy định hiện hành tại thời điểm thực tế và cập nhật thông tin khi các văn bản này chính thức có hiệu lực để đảm bảo tuân thủ đúng pháp luật. Hướng dẫn này giúp doanh nghiệp chủ động tuân thủ và tránh những rủi ro không đáng có.
Điều Kiện Phát Sinh Nghĩa Vụ Thuế và Hồ Sơ Cần Chuẩn Bị Khi Thay Đổi Mục Đích Sử Dụng
Để xác định liệu doanh nghiệp có phát sinh nghĩa vụ thuế khi tài sản cố định nhập khẩu thay đổi mục đích sử dụng hay không, cần căn cứ vào các điều kiện cụ thể và chuẩn bị đầy đủ hồ sơ theo quy định của pháp luật Việt Nam.
1. Điều kiện phát sinh nghĩa vụ thuế
Nghĩa vụ kê khai và nộp thuế mới phát sinh khi hàng hóa nhập khẩu là tài sản cố định đáp ứng đồng thời các điều kiện sau:
- Là hàng hóa nhập khẩu: Tài sản được đưa vào Việt Nam từ nước ngoài thông qua các thủ tục hải quan.
- Là tài sản cố định: Được ghi nhận là tài sản cố định trong sổ sách kế toán của doanh nghiệp theo chuẩn mực kế toán Việt Nam.
- Đã được hưởng ưu đãi thuế khi nhập khẩu: Tại thời điểm nhập khẩu ban đầu, tài sản này đã được miễn thuế nhập khẩu, thuế tiêu thụ đặc biệt (TTĐB), thuế giá trị gia tăng (GTGT), thuế bảo vệ môi trường (BVMT) hoặc áp dụng mức thuế suất ưu đãi, mức thuế tuyệt đối theo hạn ngạch thuế quan, hoặc thuộc đối tượng không chịu thuế nhập khẩu.
- Thay đổi mục đích sử dụng: Sau khi được giải phóng hàng hoặc thông quan, tài sản này không còn được sử dụng đúng mục đích ban đầu đã đăng ký để được hưởng ưu đãi thuế. Các trường hợp thay đổi mục đích phổ biến bao gồm:
- Chuyển từ mục đích được miễn thuế sang mục đích chịu thuế.
- Chuyển từ mục đích sản xuất hàng xuất khẩu sang tiêu thụ nội địa.
- Bán thanh lý, chuyển nhượng cho đối tượng khác.
- Sử dụng vào mục đích không còn thuộc diện ưu đãi thuế.
Căn cứ tại khoản 5 Điều 25 Nghị định 08/2015/NĐ-CP, được sửa đổi bởi điểm d khoản 12 Điều 1 Nghị định 167/2025/NĐ-CP, người khai hải quan phải khai tờ khai hải quan mới khi hàng hóa nhập khẩu (bao gồm tài sản cố định) đã được hưởng ưu đãi thuế hoặc thuộc đối tượng không chịu thuế nhưng sau đó thay đổi mục đích sử dụng không còn được ưu đãi. Ngoài ra, theo Công văn 2285/TCHQ-TXNK năm 2021, trường hợp công ty nhập khẩu tài sản cố định được miễn thuế, nay thay đổi mục đích sử dụng hoặc bán thanh lý, cũng phải kê khai tờ khai hải quan mới và thực hiện nghĩa vụ thuế.
Đặc biệt, theo Điều 21 Thông tư 38/2015/TT-BTC (được sửa đổi, bổ sung tại khoản 10 Điều 1 Thông tư 39/2018/TT-BTC), việc chuyển tiêu thụ nội địa hoặc thay đổi mục đích sử dụng hàng hóa nhập khẩu chỉ được thực hiện sau khi người khai hải quan hoàn thành thủ tục hải quan đối với tờ khai hải quan mới. Người nộp thuế phải kê khai và nộp đủ tiền thuế, tiền phạt (nếu có) theo quy định.
Một điểm quan trọng khác cần lưu ý là theo điểm c khoản 2 Điều 5 Nghị định 181/2025/NĐ-CP, trường hợp hàng hóa nhập khẩu thuộc đối tượng chịu thuế giá trị gia tăng và được miễn thuế nhập khẩu, nếu sau đó thay đổi mục đích sử dụng dẫn đến phát sinh số thuế nhập khẩu phải nộp, doanh nghiệp còn phải nộp thuế giá trị gia tăng bổ sung trên chính số tiền thuế nhập khẩu phải nộp này.
2. Hồ sơ cần chuẩn bị
Để thực hiện thủ tục kê khai thuế khi tài sản cố định thay đổi mục đích sử dụng, doanh nghiệp cần chuẩn bị một bộ hồ sơ đầy đủ bao gồm:
- Tờ khai hải quan ban đầu: Bản sao hoặc thông tin chi tiết của tờ khai hải quan đã đăng ký khi nhập khẩu tài sản cố định lần đầu, chứng minh việc tài sản đã được hưởng ưu đãi thuế.
- Tờ khai hải quan mới: Tờ khai hải quan điện tử hoặc tờ khai hải quan giấy (trong các trường hợp đặc biệt được phép) để khai báo lại mục đích sử dụng mới của tài sản.
- Quyết định của doanh nghiệp về việc thay đổi mục đích sử dụng: Văn bản nội bộ của doanh nghiệp (ví dụ: biên bản họp hội đồng quản trị, quyết định của giám đốc) về việc thay đổi mục đích sử dụng, thanh lý, chuyển nhượng tài sản.
- Hợp đồng mua bán, thanh lý (nếu có): Nếu tài sản được bán hoặc thanh lý, cần có hợp đồng mua bán, hóa đơn giá trị gia tăng (nếu có) liên quan đến giao dịch này.
- Chứng từ kế toán liên quan: Sổ sách kế toán, thẻ tài sản cố định, biên bản kiểm kê, biên bản đánh giá lại tài sản (nếu có) để xác định giá trị còn lại của tài sản tại thời điểm thay đổi mục đích.
- Các giấy tờ khác theo yêu cầu của cơ quan hải quan: Tùy thuộc vào từng trường hợp cụ thể, cơ quan hải quan có thể yêu cầu bổ sung các giấy tờ khác để làm rõ thông tin.
Quy Trình 5 Bước Kê Khai và Nộp Thuế Khi Tài Sản Cố Định Thay Đổi Mục Đích Sử Dụng
Quy trình kê khai và nộp thuế khi tài sản cố định nhập khẩu thay đổi mục đích sử dụng đòi hỏi sự cẩn trọng và tuân thủ nghiêm ngặt các bước theo qu