Kê khai thuế GTGT đầu vào 2025: Doanh nghiệp có nộp khai thuế quý không?

Vì sao doanh nghiệp chỉ có thuế GTGT đầu vào vẫn phải nộp khai thuế GTGT theo quý?

Hơn 60% doanh nghiệp Việt Nam gặp rủi ro khi không khai thuế GTGT dù chỉ có thuế đầu vào, vì họ cho rằng không có doanh thu nên không cần khai. Theo Điều 11 Nghị định 252/2026/NĐ‑CP, việc không phát sinh hóa đơn đầu ra không tự động tạo ra quyền miễn nộp khai thuế GTGT; doanh nghiệp vẫn phải nộp khai trừ thuế đầu vào trừ khi thuộc một trong các trường hợp được miễn nộp khai thuế được quy định tại nghị định.

Ai cần thực hiện? Tất cả các doanh nghiệp, tổ chức, cá nhân kinh doanh chịu thuế GTGT tại Việt Nam, bất kể mức doanh thu hay số lượng hóa đơn đầu ra, trừ khi đáp ứng các tiêu chí miễn nộp khai thuế.

Các trường hợp được miễn nộp khai thuế GTGT

Theo Điều 11 Nghị định 252/2026/NĐ‑CP, doanh nghiệp không phải nộp hồ sơ khai thuế GTGT trong các trường hợp sau:

• Doanh nghiệp chỉ có hoạt động, kinh doanh thuộc đối tượng không chịu thuế GTGT (ví dụ: hộ kinh doanh, cá nhân kinh doanh hàng hóa, dịch vụ có doanh thu dưới mức chịu thuế).
• Doanh nghiệp chế xuất chỉ thực hiện hoạt động chế xuất.
• Doanh nghiệp tạm ngừng hoạt động kinh doanh theo quy định tại điểm c.1 khoản 1 Điều 7 Nghị định này.
• Doanh nghiệp đã nộp hồ sơ chấm dứt hiệu lực mã số thuế và không phát sinh nghĩa vụ thuế mới.
• Doanh nghiệp là bên Việt Nam khấu trừ, nộp thay thuế GTGT của nhà thầu nước ngoài và trong tháng không phát sinh việc khấu trừ thuế.
• Doanh nghiệp thuộc diện được hoàn thuế GTGT theo quy định pháp luật và đáp ứng các điều kiện miễn nộp khai thuế (ví dụ: tổ chức thực hiện dự án ODA không hoàn lại, tổ chức sử dụng viện trợ không hoàn lại, hoặc được hưởng ưu đãi ngoại giao).

Nếu doanh nghiệp không thuộc bất kỳ trường hợp trên, việc nộp khai thuế GTGT vẫn là nghĩa vụ bắt buộc, dù không có hóa đơn đầu ra.

Điều kiện và hồ sơ cần chuẩn bị để khai thuế GTGT khi không có hóa đơn đầu ra

• Giấy chứng nhận đăng ký kinh doanh (đăng ký mã số thuế).
• Mẫu tờ khai thuế GTGT (Mẫu số 01/GTGT).
• Danh sách chi tiết các chứng từ mua hàng (hóa đơn mua, chứng từ thay thế) phát sinh thuế GTGT đầu vào trong kỳ.
• Bảng kê tổng hợp số tiền thuế GTGT đầu vào và số tiền thuế GTGT đầu ra (nếu có).
• Biên bản quyết toán nội bộ (nếu doanh nghiệp đã thực hiện quyết toán nội bộ).
• Giấy ủy quyền (nếu doanh nghiệp sử dụng dịch vụ đại lý khai thuế).

Đối với doanh nghiệp chỉ có thuế đầu vào, bảng kê sẽ có cột “Thuế GTGT đầu ra” bằng 0, nhưng vẫn phải khai đầy đủ các mục theo mẫu.

Quy trình thực hiện khai thuế GTGT theo quý khi chỉ có thuế đầu vào

1. Thu thập chứng từ mua hàng: Tập hợp tất cả hóa đơn mua, chứng từ thay thế trong quý. Đảm bảo mỗi chứng từ có mã số thuế, ngày phát hành và số tiền thuế GTGT.
2. Kiểm tra tính hợp lệ: Xác nhận rằng các chứng từ đều thuộc danh mục chịu thuế GTGT và không bị hủy bỏ.
3. Chuẩn bị bảng kê: Sử dụng phần mềm kế toán hoặc bảng tính Excel để tổng hợp tổng số thuế GTGT đầu vào và ghi lại số thuế GTGT đầu ra (nếu có, ở đây là 0).
4. Điền vào mẫu tờ khai: Nhập các số liệu vào mẫu số 01/GTGT. Các mục quan trọng:
   • Khoản 01 – Doanh thu chịu thuế (đặt 0).
   • Khoản 02 – Thuế GTGT đầu ra (đặt 0).
   • Khoản 03 – Thuế GTGT đầu vào (tổng số thuế đã khấu trừ).
   • Khoản 04 – Số thuế phải nộp (nếu thuế đầu vào > 0, sẽ là số âm, nghĩa là doanh nghiệp được khấu trừ).
5. Nộp tờ khai qua hệ thống: Đăng nhập vào cổng thông tin điện tử của Tổng cục Thuế () hoặc phần mềm kê khai thuế của cơ quan thuế địa phương, ví dụ Chi cục Thuế Long Biên. Chọn kỳ khai (quý I, II, III, IV) và tải lên tờ khai.
6. Kiểm tra và xác nhận: Hệ thống sẽ tự động kiểm tra tính hợp lệ. Nếu không có lỗi, nhấn “Xác nhận nộp hồ sơ”.
7. Lưu trữ chứng từ: Lưu lại bản sao tờ khai và các chứng từ gốc trong thời gian tối thiểu 5 năm, theo quy định của Luật Quản lý thuế 2025.

Chi phí, thời gian xử lý và ví dụ tính toán thực tế

Ví dụ thực tế: Công ty A có doanh thu 0 VNĐ trong quý I/2025, nhưng mua hàng trị giá 200.000.000 VNĐ, trong đó thuế GTGT đầu vào là 10% = 20.000.000 VNĐ. Khi khai:

• Thuế GTGT đầu ra = 0 VNĐ.
• Thuế GTGT đầu vào = 20.000.000 VNĐ.
• Số thuế phải nộp = 0 – 20.000.000 = -20.000.000 VNĐ (được khấu trừ).

Kết quả: Doanh nghiệp được khấu trừ 20.000.000 VNĐ và có thể chuyển sang kỳ sau hoặc yêu cầu hoàn thuế nếu đủ điều kiện.

Câu hỏi thường gặp (FAQ) về khai thuế GTGT khi không có hóa đơn đầu ra

Doanh nghiệp có phải nộp khai thuế GTGT nếu không có doanh thu trong quý?

Đúng. Theo Nghị định 252/2026/NĐ‑CP, mọi đối tượng chịu thuế GTGT phải nộp khai thuế theo kỳ, kể cả khi không phát sinh doanh thu hoặc không có hóa đơn đầu ra, trừ khi doanh nghiệp thuộc một trong các trường hợp được miễn nộp khai thuế (xem mục trên).

Làm sao để chứng minh không có hóa đơn đầu ra?

Trong phần ghi chú của mẫu tờ khai, doanh nghiệp cần ghi rõ “Không phát sinh doanh thu, không có hóa đơn đầu ra trong kỳ” và đính kèm biên bản nội bộ xác nhận không có giao dịch bán hàng. Các chứng từ mua hàng vẫn phải được lưu trữ đầy đủ.

Doanh nghiệp có thể khai bổ sung sau khi đã nộp tờ khai nếu phát hiện sai sót?

Có. Theo Điều 12 Luật Quản lý thuế 2025, doanh nghiệp có quyền khai bổ sung trong thời hạn 05 năm kể từ ngày hết thời hạn nộp tờ khai, nếu phát hiện sai sót về số thuế GTGT đầu vào hoặc các thông tin khác.

Tóm tắt và bước tiếp theo cho doanh nghiệp

Doanh nghiệp chỉ có thuế GTGT đầu vào, không có hóa đơn đầu ra, vẫn phải nộp khai thuế GTGT nếu không thuộc các trường hợp miễn nộp khai thuế được quy định tại Điều 11 Nghị định 252/2026/NĐ‑CP. Quy trình khai thuế, hồ sơ cần chuẩn bị và các lưu ý đã được trình bày ở trên. Đảm bảo nộp đúng hạn để duy trì quyền khấu trừ và tránh các hình phạt.