Hoàn thuế GTGT 2026: 6 vướng mắc KoCham giải đáp + hướng dẫn chi tiết

Hoàn thuế GTGT 2026: 6 vướng mắc KoCham giải đáp + hướng dẫn chi tiết

Theo Công văn 5200/CT‑CS năm 2026 do Cục Thuế ban hành ngày 24/07/2026, các vướng mắc về hoàn thuế GTGT, ưu đãi thuế TNDN và thỏa thuận APA được giải đáp chi tiết, bao gồm 6 nội dung chính.

Hoàn thuế GTGT trong giai đoạn đầu tư và xuất khẩu: Quy định mới từ 01/07/2026

Tóm tắt: Cục Thuế trả lời 06 vướng mắc của KoCham về hoàn thuế GTGT, ưu đãi TNDN và thỏa thuận APA, đồng thời công bố quy định mới từ 01/07/2026 về hoàn thuế, thuế suất 0% cho xuất khẩu, xác định tiền thuê đất, nguyên vật liệu FOC và thuê lại lao động. Doanh nghiệp cần nắm rõ quy trình, thời hạn và tránh các sai sót để không bị phạt.
Thông tin quan trọng:

  • Để minh họa, giả sử Công ty X có doanh thu xuất khẩu 10 tỷ đồng trong năm 2026 và đã nộp GTGT 10% (1 tỷ đồng)
  • Thuế suất GTGT 0% cho giao dịch xuất khẩu và nhập khẩu tại chỗ: Hướng dẫn thực hiện
    Theo Công văn 4425/CT‑CS ngày 01/07/2026, các giao dịch xuất khẩu và nhập khẩu tại chỗ sẽ được áp dụng mức thuế GTGT 0%
  • Loại giao dịchThuế suất GTGT trước 01/07/2026Thuế suất GTGT sau 01/07/2026 Xuất khẩu hàng hóa10%0% Nhập khẩu tại chỗ10%0%

    Doanh nghiệp cần cập nhật phần mềm kế toán để tự động áp dụng mức thuế 0% khi nhập hoặc xuất khẩu, tránh việc tính sai thuế

  • ⚠️ Mức phạt: Nếu doanh nghiệp không thông báo hoặc thực hiện APA sai quy định, có thể bị phạt từ 0,5% đến 2% doanh thu chịu thuế của năm trước
  • Sau khi cung cấp đầy đủ hồ sơ, cơ quan thuế chấp nhận phương pháp giá chuyển giao (Transfer Pricing) dựa trên mức lợi nhuận ròng (Net Profit Margin) 5%
Chi phí: 10 tỷ
Hạn nộp: Hạn nộp: Hồ sơ hoàn thuế GTGT phải được nộp trước ngày 30/09/2026 để được xét duyệt trong năm tài chính 2026

Bạn có biết rằng từ ngày 01/07/2026, Luật Quản lý thuế 2025 sẽ chính thức có hiệu lực, đồng thời Cục Thuế sẽ tăng tốc độ xử lý hồ sơ hoàn thuế GTGT? Đây là câu trả lời quan trọng cho các doanh nghiệp đang gặp khó khăn trong việc khai báo và nhận lại thuế GTGT đã nộp.

Infographic: Hoàn thuế GTGT 2026: 6 vướng mắc KoCham giải đáp + hướng dẫn chi tiết
Infographic — Hoàn thuế GTGT 2026: 6 vướng mắc KoCham giải đáp + hướng dẫn chi tiết

Đối với hồ sơ đầy đủ, đáp ứng đầy đủ các điều kiện hoàn thuế và có mức độ rủi ro thấp, cơ quan thuế sẽ giải quyết ngay lập tức, bảo đảm quyền lợi hợp pháp của doanh nghiệp. Ngược lại, nếu hồ sơ có dấu hiệu rủi ro về hóa đơn, nguồn gốc hàng hóa hoặc dòng tiền, cơ quan thuế sẽ tiến hành kiểm tra, xác minh dựa trên quản lý rủi ro.

⏰ Hạn nộp: Hồ sơ hoàn thuế GTGT phải được nộp trước ngày 30/09/2026 để được xét duyệt trong năm tài chính 2026.

Để minh họa, giả sử Công ty X có doanh thu xuất khẩu 10 tỷ đồng trong năm 2026 và đã nộp GTGT 10% (1 tỷ đồng). Nếu đáp ứng đủ điều kiện hoàn thuế, công ty sẽ được hoàn lại toàn bộ 1 tỷ đồng, giảm chi phí hoạt động đáng kể.

Xác định tiền thuê đất cho dự án đầu tư: Cập nhật Nghị định 103/2024 và 291/2025

Việc tính toán tiền thuê đất đã được quy định chi tiết trong Điều 44 Nghị định 103/2024/NĐ-CP và được bổ sung tại Điều 1 Nghị định 291/2025/NĐ-CP. Cơ quan thuế sẽ dựa trên phiếu chuyển thông tin từ cơ quan quản lý đất đai để xác định số tiền thuê đất, bao gồm cả tiền thuê đất có mặt nước và tiền thuê đất cho công trình ngầm.

  • Tiền thuê đất được tính dựa trên giá trị đất hiện hành và thời gian sử dụng.
  • Tiền thuê đất được miễn giảm sẽ phải thu hồi theo quy định tại Điều 17 và Điều 38 Nghị định này.
  • Doanh nghiệp cần cung cấp đầy đủ phiếu chuyển thông tin và hợp đồng thuê đất để tránh việc bị trả lại tiền.

Ví dụ: Dự án Y thuê đất 5.000 m² với mức giá thuê 200.000 VND/m²/năm trong 10 năm. Tổng tiền thuê đất = 5.000 × 200.000 × 10 = 10.000.000.000 VND.

Thuế suất GTGT 0% cho giao dịch xuất khẩu và nhập khẩu tại chỗ: Hướng dẫn thực hiện

Theo Công văn 4425/CT‑CS ngày 01/07/2026, các giao dịch xuất khẩu và nhập khẩu tại chỗ sẽ được áp dụng mức thuế GTGT 0%. Điều này giúp doanh nghiệp giảm chi phí thuế và tăng tính cạnh tranh trên thị trường quốc tế.

Loại giao dịchThuế suất GTGT trước 01/07/2026Thuế suất GTGT sau 01/07/2026
Xuất khẩu hàng hóa10%0%
Nhập khẩu tại chỗ10%0%

Doanh nghiệp cần cập nhật phần mềm kế toán để tự động áp dụng mức thuế 0% khi nhập hoặc xuất khẩu, tránh việc tính sai thuế.

Nguyên vật liệu FOC và ưu đãi thuế TNDN: Khi nào được miễn thuế?

FOC (Free of Charge) là nguyên vật liệu được cung cấp mà không phải thanh toán. Theo Điều 3 và khoản 9 Điều 23 Nghị định 320/2025/NĐ-CP, các khoản thu nhập từ quà biếu, hàng hóa nhận được không phải thanh toán sẽ không được hưởng ưu đãi thuế TNDN.

  • Đánh giá bản chất giao dịch: Nếu nguyên vật liệu được cung cấp như một phần của hợp đồng tài trợ, sẽ tính vào thu nhập chịu thuế.
  • Hợp đồng và chứng từ: Cần có hợp đồng rõ ràng, ghi rõ mục đích sử dụng và quyền sở hữu.
  • Hạch toán kế toán: Ghi nhận đúng khoản chi phí hoặc doanh thu tương ứng.

Ví dụ: Công ty Z nhận nguyên vật liệu FOC trị giá 500 triệu đồng từ đối tác. Nếu không có hợp đồng tài trợ, khoản này sẽ được tính là thu nhập chịu thuế và không được giảm thuế TNDN.

Thỏa thuận APA: Nguyên tắc, quy trình và thời gian áp dụng

APA (Advance Pricing Agreement) là thỏa thuận trước về phương pháp xác định giá giao dịch liên quan. Theo Khoản 3 Điều 31 Luật Quản lý thuế 2025, APA có hiệu lực từ ngày 01/07/2026.

  • Nguyên tắc minh bạch: Cơ quan thuế sẽ thu thập thông tin từ người nộp thuế, cơ sở dữ liệu thương mại, sàn giao dịch và các nguồn công khai.
  • Quy trình: Đánh giá giao dịch, lựa chọn đối tượng so sánh, đề xuất phương pháp tính giá và đàm phán với cơ quan thuế nước ngoài.
  • Tiêu chí ưu tiên: Độ đầy đủ hồ sơ, tính chất giao dịch, thời gian đề nghị và khả năng phối hợp với cơ quan thuế đối tác.
⚠️ Mức phạt: Nếu doanh nghiệp không thông báo hoặc thực hiện APA sai quy định, có thể bị phạt từ 0,5% đến 2% doanh thu chịu thuế của năm trước.

Ví dụ thực tế: Doanh nghiệp A đề nghị APA cho giao dịch nội bộ với công ty con ở Hàn Quốc. Sau khi cung cấp đầy đủ hồ sơ, cơ quan thuế chấp nhận phương pháp giá chuyển giao (Transfer Pricing) dựa trên mức lợi nhuận ròng (Net Profit Margin) 5%.

Thuê lại lao động và thuế GTGT, TNDN: Các lưu ý quan trọng

Về việc cho thuê lại lao động, Cục Thuế đã đưa ra hướng dẫn trong Công văn 5200/CT‑CS năm 2026 trả lời các câu hỏi liên quan. Các doanh nghiệp cần lưu ý:

  • Thuế GTGT: Dịch vụ cho thuê lại lao động chịu thuế GTGT 10%.
  • Thuế TNDN: Thu nhập từ hoạt động cho thuê lại lao động được tính vào thu nhập chịu thuế TNDN.
  • Phạm vi hoạt động: Dựa trên Nghị định 145/2020/NĐ‑CP, chỉ các dịch vụ lao động được phép cho thuê lại mới được tính thuế.

Doanh nghiệp nên liên hệ với cơ quan quản lý lao động để được hướng dẫn chi tiết về danh mục công việc được phép cho thuê lại.

Câu hỏi thường gặp (FAQ)

Doanh nghiệp có phải nộp hóa đơn điện tử khi bán ngoại tệ không?

Theo khoản 4 Điều 7 Nghị định 254/2026/NĐ‑CP, giao dịch bán ngoại tệ không phải sử dụng hóa đơn điện tử, nhưng doanh nghiệp phải lập bảng tổng hợp chi tiết giao dịch bán ngoại tệ mỗi tháng và cung cấp khi cơ quan thuế yêu cầu.

Làm sao để xác định nguyên vật liệu FOC có được hưởng ưu đãi thuế TNDN?

Đánh giá dựa trên

Đội ngũ ANC Việt Nam
Chuyên viên Kế toán Thuế

Chứng chỉ hành nghề Kế toán
Chứng chỉ Đại lý Thuế

Với 10 năm kinh nghiệm trong lĩnh vực thuế và kế toán, tôi đã tư vấn cho hàng nghìn doanh nghiệp về các vấn đề thuế, kế toán và tuân thủ pháp luật

LinkedIn



Để lại một bình luận